Снаружи узел монтажа орудия закрывался бронемаской, форма которой напоминала свиное рыло (Saukopfblende). Узел установки орудия и маска в процессе серийного производства неоднократно модернизировались. Свои усилия конструкторы направляли на одновременное снижение массы узла и повышение стойкости к снарядам и осколкам. Самый последний вариант имел массу на 200 кг меньшую, чем первый.
Орудие 7,5 cm Pak-39 имело полувтоматический затвор и электроспуск. Длина ствола 3600 м (48 калибров), количество нарезов в стволе -32, нарезы расположены под углом 7 град к оси ствола. Длина отката ствола после выстрела -600-630 мм. Углы обстрела орудия истребителя танков Jagdpanzer-38 в вертикальной плоскости от -6 град, до + 12 град., в горизонтальной – от 11 град вправо до 5 град, влево от продольной оси. Дальность стрельбы бронебойным снарядом – 3000 м, фугасным – 3600 м.
В состав боекомплекта входили бронебойный снаряд М.39, подкалиберный М.40 и фугасный. Масса снаряда М.39 – 6,8 кг. начальная скорость 750 м/с; масса снаряда М.40 -4,15 кг, начальная скорость 930 м/с; масса фугасного снаряда 5,74 кг, начальная скорость 550 м/с. Наведение орудия осуществляется с помощью прицела прямой наводки SF-la. Боекомплект – 41 снаряд.
На швейцарских истребителях танков использовались пушки 7,5 cm StuK-40. Конструктивно орудия StuK-40 и StuK-39 очень похожи, имеют сходные характеристики и одинаковые посадочные места для установки на танк или самоходку. Внешне орудие StuK-40 легко отличить от StuK-39 по наличию дульного тормоза.
В качестве вспомогательного вооружения на истребителе танков устанавливался универсальный пулемет MG-34. Пулемет монтировался на крыше боевого отделения в специальной турели и имел круговой обстрел по горизонту, сектор обстрела в вертикальной плоскости ограничивался несколькими градусами. Наведение и стрельба из пулемета осуществлялось дистанционно из боевого отделения при закрытом верхнем
люке. Пулеметная турель и магазин с патронами прикрывались V-образным в плане бронещитком. Магазин вмещал 50 патронов. Для замены магазина наводчику требовалось высунуться из люка, что в боевой обстановке было сопряжено с риском. В боевом отделении хранилось двенадцать 50-патронных магазинов.
Самоходки также комплектовались одной штурмовой винтовкой StG-44 калибра 7,92 мм и шестью магазинами на 180 патронов. Винтовку можно было использовать только вне боевого отделения.
На «Хетцере» испытывалось специальное приспособление, позволявшее стрелять из StG-44 изнутри машины, при этом сама винтовка комплектовалась насадкой, искривляющей траекторию полета пули. Кроме того, в боевом отделении хранился контейнер с 12 сигнальными ракетами, 20 ручных гранат Ei.39, шесть дымовых шашек. Личным оружием членов экипажа являлись пистолеты «Вальтер» Р-38. К каждому пистолету полагалось по две запасных обоймы.
